DNAMAN如何引物设计？DNAMAN引物设计教程

DNAMAN是一款集引物设计、序列分析、质粒绘图、蛋白质分析为一体的综合序列分析软件。今天欧普小编和大家探讨一下引物设计这个功能，比较核心的功能，一起来看下！

DNAMAN引物设计教程

1、首先要拿到自己要设计引物的目的基因。这里我使用一段GFP基因给大家讲解。将目的基因保存在txt文档里面，或者直接复制下来后在DNAMAN里面新建文档复制进去。下面是我们要设计引物的GFP基因序列。

2、打开DNAMAN，选择菜单里面的Primer-->Load Primer-->From Input。将上一步中的目的基因序列从开头开始的20个左右的碱基复制粘贴进去(引物长度要在15—30bp之间，常用的是18-27bp)，比如我们先试试前20个碱基是否合适，将ATTGATGTGATATCTCCACT这20个碱基复制粘贴进去，点击OK。

3、再次点击Primer，选择Melting Temperature，打开对话框。这里面可以看到你的碱基序列，个数以及Thermo，也即Tm值，是溶解温度。Tm值一般在55℃到70℃之间比较好，PCR仪的退火温度一般设定比primer的Tm低5℃(不过一般情况我们都设定为55℃，因此Tm值在60左右比较好)。

4、从上图可以看到我们这20个碱基的Tm值只有49度，显然太低，需要增加碱基数量。我们取前24个碱基粘贴进去，点击下方Show Tm便可以看到这个引物的Tm值，发现是60.3度，很合适，就用这个了。这样正向引物就设计完了，把这24个碱基序列保存下来。