DNAMAN9免费版是一款专业的序列分析工具,主要功能包括多重序列对比、PCR引物设计、蛋白质分析、质粒绘图等功能,广泛应用在各大研究实验方面,DNAMAN 9带来了编辑记录信息、数据库管理、DNA和蛋白质数据库编辑等功能,需要的朋友赶快下载吧!
1、数据库管理
选择数据库|经理命令打开数据库管理器”对话框。
2、DNA和蛋白质数据库
该软件的数据库功能,允许用户组织DNA和蛋白质序列的不同科目。
3、编辑记录信息
有关特定记录的信息可以编辑,在序列列表框中,所有记录按字母顺序或记录顺序列出,每个记录名字的数量显示记录的记录号ID.用DNAMAN自动分配。因此,您可以为不同的记录使用相同的名称。
4、扫描序列的相似性
它扫描所有的序列记录在默认的数据库搜索当前序列的同源序列。如果默认数据库包含DNA序列,则默认序列必须是DNA序列,如果默认数据库包含蛋白质序列,则默认序列必须是蛋白质序列。DNAMAN将使用快速对准方法扫描数据库的序列相似性,您可以选择对结果的最终输出使用快速对齐或最佳对齐方式。
5、错配分析
错配分析的目的是找到所有可能的退火位点的DNA序列的引物在默认,此功能可用于PCR和DNA测序的引物选择,权重矩阵用来区分引物位置的重要性。由于引物在3’末端对目标DNA的匹配比PCR扩增的5末端更重要,所以更多的权重被赋予3’末端。为了提高PCR引物的特异性,应始终检查引物与靶DNA之间是否存在次级退火位点。
1、DNA和蛋白质序列编辑
2、DNA序列转化
3、多序列比对,对齐编辑和分析
4、系统树分析
5、DNA或蛋白质序列的点阵比较
6、DNA序列组装和编辑
7、BLAST通过网络界面在Intranet/Internet Server上进行搜索
8、序列和数据库中的增强型图案搜索
9、SiRNA选择器
10、限制分析
11、绘制序列图与出版品质
12、限制模式预测
13、电子克隆
14、从限制片段重建限制图
15、静音突变分析创建/破坏限制性位点
16、导向不匹配以创建/破坏限制站点
17、翻译和密码子使用分析
18、蛋白质疏水性/亲水性分析
19、蛋白质表征:等电点的序列组成和预测
20、蛋白质二级结构预测
21、反向翻译
22、PCR和测序引物的设计
23、表征DNA或引物序列的热力学性质
24、分歧分析
25、管理寡核苷酸,DNA和蛋白质数据库
26、生成随机序列
软件制作序列比对图方法
图1
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图10
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