[b]simvector免费版[/b]是一款专业的DNA分析和质粒图绘制软件,可以设计出各种矢量图、质粒图、载体图和序列图,支持自动生成发表质量的载体图谱,从而帮助生物学家进行试验设计和分析,小编还带来了simvector使用教程,需要的朋友可以下载!
多克隆位点(MCS)展示
Vector目录通常以一个独特的格式显示MCS's,酶一个一个地显示在纵向表格中。SimVector通过解释GenBank头注释识别MCS's,或者您也可以直接指定他们。然后,他们会以“Bracket View”这种特殊的方式将位点展示出来。除此以外,它还可以列出只在MCS内剪切的酶。
快速的克隆模拟
SimVector将来自GeneBank或者本地文件的序列注释转换为注解详细的图谱。克隆向导可以帮助您通过普及的重组规则,如Gateway® 克隆,TA克隆以及一或两个的酶限制性克隆。ORF 搜索可以帮助您确保结构处于框架内。您可以点击按钮,翻译表达蛋白的序列以检查可能存在的阅读框错误。使用SimVector,克隆模拟变得非常简单,只需要点击几个按钮就可以完成。
限制性内切酶分析
SimVector 具有全面的限制性内切酶分析功能,从超过一千种限制性内切酶的数据库或预装的商业酶集里选择需要的酶。SimVector 还可以为您订制自己的酶集合。
生物学家设计直观界面
SimVector 有一个直观的可进行限制克隆和序列分析的生物学家设计界面。傻瓜式的操作令初学者也可以简单地进行操作。同时,其通用的功能确保专家学者们可以完全控制图谱的绘制。
首先,可以新建一个文件,输入核酸序列。如下
随后,软件自动生成一个质粒图,可以根据需要以闭合环状或线状形式显示,在绘图栏点击右键可以更改质粒图的各项属性,在工具栏中也都具有相应按钮。如下:
在序列栏中选择相应的序列为质粒图填加各种注释,点击绘图栏中feature选项,点击add,副选框antisense可以更改箭头的方向,工具烂中的各个选项可以分别按需要更改注释字体,大小,颜色;条带的宽窄,线条粗细,虚实,填充,颜色,形状等。
Feature的改变
限制性酶切位点:在绘图栏的Enzyme选项中显示了当前编辑的质粒的酶切位点的各种信息,包括位置,数量,酶切碱基等。
可以更改软件的内切酶库:tools/Restriction Analysis可以更改内切酶的数据库,这里的选择性很大,不过一般来说,默认的Common Enzymes已足够满足大多数人一般需要了。
图像输出:File/Export vector可以以这种方式输出,有各种图片形式、矢量图、网页及幻灯片,十分方便,而且效果也很好。
Simvector 3对网络的支持也很到位,还可以添加代理,为内网用户提供了极大的方便。
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